Quand des ninja passent gennin ils peuvent a se moment la former des éuipe de trois. Un senseï a l'académie ou un kage peut former les équipe, pour former les équipe les trois ninja doivent être du meme village. Quand un ninja ou tout les ninja de l'équipe passe au niveau chunnin il quitte leur équipe.
Chaque équipe aura un senseï de niveau junnin, c'est lui qui dirigera les mission par équipe. Si la mission se passe mal c'est lui qui en engendrera les responsabilité, exemple:
-si un ninja meurt lors de la mission
-si la mission rate
-ou si l'équipe se fait capturer.
Pour que les missions par équipe fonctionnent très bien les ninja doivent tous poster le plus vite possible.